Spoločnosť Naturalis SK, s.r.o. vykonáva kontrolu a certifikáciu od roku 2004. Niektorí inšpektori vykonávali svoju činnosť ešte pred vznikom spoločnosti ako členovia združenia Naturalis a predtým na základe menovacích dekrétov vtedajšieho Ministerstva pôdohospodárstva Slovenskej republiky (MP SR).
Spoločnosť Naturalis SK, s.r.o., bola založená dňa 10.03.2004. Hlavnými predmetmi podnikania sú kontrola a certifikácia v ekologickej poľnohospodárskej výrobe (EPV).
Výkonom kontroly a certifikácie je spoločnosť oprávnená u prevádzkovateľov zaoberajúcich sa produkciou nespracovaných poľnohospodárskych produktov a živých zvierat v EPV , t.j. rastlinná výroba vrátane zberu voľne rastúcich rastlín a ich častí a pestovania húb a živočíšna výroba vrátane chovu včiel; prevádzkovateľov zaoberajúcich sa výrobou biopotravín, biokrmív a kŕmnych zmesí, bioosív a vegetatívneho množiteľského materiálu; balením, prebaľovaním a označovaním produktov v EPV; dovozcov a vývozcov bioproduktov z tretích krajín; obchodníkov, distribútorov a skladovateľov produktov v EPV.
Oprávnenie na výkon činnosť bolo vydané Ústredným kontrolným a skúšobným ústavom poľnohospodárskym Bratislava (ÚKSÚP) s platnosťou do 17.12.2019.
Od 01.07.2010 používa Naturalis SK číselný kód SK-BIO-002, ktorý je zverejnený v zozname kontrolných organizácií členských štátov EÚ, vydaného Európskou komisiou. Tento kód je zapracovaný aj v logu inšpekčnej organizácie.
Kontrolnú činnosť a certifikáciu vykonáva Naturalis SK, s.r.o., v súlade s platnou legislatívou – Nariadením Rady (ES) č. 834/2007 o ekologickej výrobe a označovaní ekologických produktov, ktorým sa zrušuje nariadenie (EHS) č. 2092/91, Nariadením Komisie (ES) č. 889/2008, ktorým sa ustanovujú podrobné pravidlá implementácie nariadenia Rady (ES) č. 834/2007 o ekologickej výrobe a označovaní ekologických produktov so zreteľom na ekologickú výrobu, označovanie a kontrolu a Zákonom č. 189/2009 Z.z. o ekologickej poľnohospodárskej výrobe.
Výkon kontroly sa vykonáva aj v súlade s nariadením Európskeho parlamentu a Rady (ES) č. 882/2004 o úradných kontrolách uskutočňovaných s cieľom zabezpečiť overenie dodržiavania potravinového a krmivového práva a predpisov o zdraví zvierat a o starostlivosti o zvieratá.
Naturalis SK, s.r.o., je akreditovaný Slovenskou národnou akreditačnou službou (SNAS) podľa požiadaviek ISO/IEC 17065:2012 (Osvedčenie o akreditácii č. P-022 – certifikačný orgán), po zmene sídla spoločnosti v roku 2017 bolo vydané osvedčenie s platnosťou od 18.07.2017 do 06.07.2020.
Zároveň je Naturalis SK akreditovaný podľa požiadaviek ISO/IEC 17020:2012 (Osvedčenie o akreditácii č. I-031 – inšpekčný orgán typu A). Na základe vykonaného dohľadu vydal SNAS dňa 06.09.2017 Rozhodnutie a Osvedčenie o akreditácii č. I-031 inšpekčného orgánu Naturalis SK, s.r.o. pre oblasť inšpekcia ekologickej poľnohospodárskej výroby a inšpekcia výroby kozmetických výrobkov obsahujúcich suroviny pochádzajúce z EPV do 17.12.2019.